目的建立鉴定登革病毒型别的双重实时Taqman PCR反应体系,以准确快速鉴定登革病毒型别。方法根据GenBank上已发表的登革病毒四个型别的全基因序列,进行对比分析,分别设计登革病毒的四个型别引物和探针,登革I、III型探针用FAM-TAMARA标记,登革II、IV型探针用JOE-TAMARA标记。经过条件优化后,建立检测登革病毒I/II型和III/IV型的两套双重实时荧光RT-PCR方法,扩增四型登革病毒RNA、登革病毒阴性样本和登革病毒RNA稀释样本,检测方法的特异性、重复性和检测限性。结果通过设计筛选序列和优化反应条件,建立登革病毒I、II型和登革病毒III、IV型的双重荧光PCR反应体系,通过试验证明,所建立的方法具有良好的特异性、重复性和检测限性,能准确快速地对登革病毒进行分型。结论建立了一种快速双重荧光PCR方法能同时对登革病毒进行分型和鉴定。
目的建立基于TaqMan探针三重荧光PCR检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)方法。方法根据nuc(GenBank:EF529607.1)、mecA(GenBank:JN108029.1)和femA gene(GenBank:DQ352463.1)基因序列,分别设计特异性引物和Taqman探针,nuc探针5、端标记TET、mecA探针5、端标记HEX、femA探针5、端标记FAM,建立基于Taqman探针三重荧光PCR检测MRSA的方法,并对69株金黄色葡萄球菌分离株进行基因检测与耐药表型比较。结果 MRSA出现femA、mecA、nuc基因扩增曲线,而表皮葡萄球菌等14株对照菌株扩增结果呈阴性;femA、mecA、nuc基因的扩增效率分别为104%、90.3%、98%,线性系数R2分别为0.999、0.994、0.998;69株分离株中femA、nuc基因阳性率为100%,mecA基因阳性率为13.04%,mecA与耐甲氧西林表型符合率为100%。结论建立的方法特异性强、准确,为金黄色葡萄球菌鉴定和耐药基因分析提供参考依据。
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